Protein–RNA interactions for Protein: Q5SY13

COL5A1-AS1, Putative uncharacterized protein encoded by COL5A1-AS1, humanhuman

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Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL5A1-AS1Q5SY13 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
COL5A1-AS1Q5SY13 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
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COL5A1-AS1Q5SY13 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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COL5A1-AS1Q5SY13 SYNRG-229ENST00000621136 4841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
COL5A1-AS1Q5SY13 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
COL5A1-AS1Q5SY13 RASGEF1C-202ENST00000393371 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
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COL5A1-AS1Q5SY13 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
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