Protein–RNA interactions for Protein: P15923

TCF3, Transcription factor E2-alpha, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCF3P15923 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF3P15923 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF3P15923 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF3P15923 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF3P15923 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF3P15923 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF3P15923 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF3P15923 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF3P15923 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF3P15923 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF3P15923 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF3P15923 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF3P15923 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF3P15923 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF3P15923 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF3P15923 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF3P15923 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF3P15923 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF3P15923 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF3P15923 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF3P15923 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF3P15923 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF3P15923 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF3P15923 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF3P15923 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF3P15923 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF3P15923 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF3P15923 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF3P15923 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF3P15923 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF3P15923 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF3P15923 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF3P15923 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TCF3P15923 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 TACR2-203ENST00000619173 1713 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 ETV7-201ENST00000339796 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TCF3P15923 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF3P15923 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF3P15923 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF3P15923 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF3P15923 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF3P15923 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF3P15923 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF3P15923 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF3P15923 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF3P15923 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF3P15923 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF3P15923 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF3P15923 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF3P15923 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF3P15923 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF3P15923 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF3P15923 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF3P15923 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TCF3P15923 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms