Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXS3

KLHL28, Kelch-like protein 28, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL28Q9NXS3 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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KLHL28Q9NXS3 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 GDF2-201ENST00000581492 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
KLHL28Q9NXS3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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