Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP140Q13342 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP140Q13342 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP140Q13342 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP140Q13342 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP140Q13342 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP140Q13342 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP140Q13342 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP140Q13342 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP140Q13342 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP140Q13342 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SP140Q13342 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP140Q13342 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP140Q13342 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP140Q13342 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP140Q13342 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SP140Q13342 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP140Q13342 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP140Q13342 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP140Q13342 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP140Q13342 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP140Q13342 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP140Q13342 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SP140Q13342 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP140Q13342 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP140Q13342 AP003397.1-201ENST00000525706 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP140Q13342 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SP140Q13342 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP140Q13342 TMEM53-204ENST00000372243 1579 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP140Q13342 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP140Q13342 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP140Q13342 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP140Q13342 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP140Q13342 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP140Q13342 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP140Q13342 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP140Q13342 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP140Q13342 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP140Q13342 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP140Q13342 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP140Q13342 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SP140Q13342 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP140Q13342 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP140Q13342 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SP140Q13342 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP140Q13342 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SP140Q13342 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP140Q13342 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SP140Q13342 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP140Q13342 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP140Q13342 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP140Q13342 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SP140Q13342 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SP140Q13342 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SP140Q13342 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP140Q13342 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SP140Q13342 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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SP140Q13342 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SP140Q13342 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SP140Q13342 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP140Q13342 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP140Q13342 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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SP140Q13342 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP140Q13342 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP140Q13342 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP140Q13342 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP140Q13342 EEF1B2-202ENST00000392221 880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP140Q13342 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP140Q13342 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SP140Q13342 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP140Q13342 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP140Q13342 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SP140Q13342 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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