Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2K6

KLHL42, Kelch-like protein 42, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL42Q9P2K6 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 FGFR4-201ENST00000292408 3122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 ACSM1-204ENST00000520010 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KLHL42Q9P2K6 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KLHL42Q9P2K6 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms