Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 HERPUD1-201ENST00000300302 1862 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 PTBP1-202ENST00000350092 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 C4orf3-202ENST00000504110 667 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 YPEL2-205ENST00000585166 881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
NTRK3Q16288 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
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