Protein–RNA interactions for Protein: Q16288

NTRK3, NT-3 growth factor receptor, humanhuman

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Length 839 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK3Q16288 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC39.69■■■■□ 3.94
NTRK3Q16288 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
NTRK3Q16288 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC38.76■■■■□ 3.8
NTRK3Q16288 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.66■■■■□ 3.78
NTRK3Q16288 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
NTRK3Q16288 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
NTRK3Q16288 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
NTRK3Q16288 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
NTRK3Q16288 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC37.92■■■■□ 3.66
NTRK3Q16288 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC37.84■■■■□ 3.65
NTRK3Q16288 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
NTRK3Q16288 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC37.57■■■■□ 3.6
NTRK3Q16288 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
NTRK3Q16288 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.06■■■■□ 3.52
NTRK3Q16288 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
NTRK3Q16288 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC36.71■■■■□ 3.47
NTRK3Q16288 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
NTRK3Q16288 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
NTRK3Q16288 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NTRK3Q16288 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
NTRK3Q16288 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
NTRK3Q16288 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC36.4■■■■□ 3.42
NTRK3Q16288 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.42
NTRK3Q16288 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC36.27■■■■□ 3.4
NTRK3Q16288 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
NTRK3Q16288 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
NTRK3Q16288 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
NTRK3Q16288 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
NTRK3Q16288 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
NTRK3Q16288 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
NTRK3Q16288 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.75■■■■□ 3.31
NTRK3Q16288 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.66■■■■□ 3.3
NTRK3Q16288 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.6■■■■□ 3.29
NTRK3Q16288 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
NTRK3Q16288 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
NTRK3Q16288 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NTRK3Q16288 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
NTRK3Q16288 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NTRK3Q16288 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NTRK3Q16288 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NTRK3Q16288 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
NTRK3Q16288 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.21■■■■□ 3.23
NTRK3Q16288 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.16■■■■□ 3.22
NTRK3Q16288 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.15■■■■□ 3.22
NTRK3Q16288 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC35.14■■■■□ 3.22
NTRK3Q16288 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
NTRK3Q16288 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
NTRK3Q16288 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
NTRK3Q16288 NKAIN4-203ENST00000370316 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
NTRK3Q16288 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.05■■■■□ 3.2
NTRK3Q16288 C11orf68-202ENST00000449692 1559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
NTRK3Q16288 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
NTRK3Q16288 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC35■■■■□ 3.19
NTRK3Q16288 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
NTRK3Q16288 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC34.7■■■■□ 3.15
NTRK3Q16288 NT5M-207ENST00000616989 1635 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NTRK3Q16288 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NTRK3Q16288 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NTRK3Q16288 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
NTRK3Q16288 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NTRK3Q16288 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NTRK3Q16288 RAN-202ENST00000392369 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
NTRK3Q16288 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
NTRK3Q16288 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
NTRK3Q16288 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
NTRK3Q16288 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
NTRK3Q16288 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
NTRK3Q16288 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
NTRK3Q16288 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
NTRK3Q16288 LIMCH1-211ENST00000509638 1570 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
NTRK3Q16288 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NTRK3Q16288 ECHS1-201ENST00000368547 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
NTRK3Q16288 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
NTRK3Q16288 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NTRK3Q16288 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NTRK3Q16288 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NTRK3Q16288 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NTRK3Q16288 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NTRK3Q16288 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
NTRK3Q16288 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NTRK3Q16288 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NTRK3Q16288 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NTRK3Q16288 Z97634.1-201ENST00000412293 1715 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NTRK3Q16288 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
NTRK3Q16288 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
NTRK3Q16288 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NTRK3Q16288 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NTRK3Q16288 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NTRK3Q16288 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NTRK3Q16288 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NTRK3Q16288 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
NTRK3Q16288 AC145285.7-201ENST00000614819 1539 ntBASIC33.81■■■■□ 3
NTRK3Q16288 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC33.76■■■□□ 2.99
NTRK3Q16288 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.75■■■□□ 2.99
NTRK3Q16288 NT5M-201ENST00000389022 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
NTRK3Q16288 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
NTRK3Q16288 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
NTRK3Q16288 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NTRK3Q16288 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NTRK3Q16288 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
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