Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 CLRN1-203ENST00000328863 738 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 AC025810.1-201ENST00000569986 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ITSN1Q15811 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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