RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517127.1

RNA5SP423-201, Transcript of RNA, 5S ribosomal pseudogene 423, humanhuman

BASIC

Gene RNA5SP423, Length 109 nt, Biotype rRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNA5SP423-201ENST00000517127 NISCHQ9Y2I1 1504 aa37■■■■□ 3.51
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RNA5SP423-201ENST00000517127 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa32.1■■■□□ 2.73
RNA5SP423-201ENST00000517127 NACADO15069 1562 aa31.76■■■□□ 2.67
RNA5SP423-201ENST00000517127 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP31.57■■■□□ 2.64
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RNA5SP423-201ENST00000517127 MYO15BQ96JP2 1530 aa31.18■■■□□ 2.58
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RNA5SP423-201ENST00000517127 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa30.72■■■□□ 2.51
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RNA5SP423-201ENST00000517127 SCRIBQ14160 1630 aa30.42■■■□□ 2.46
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RNA5SP423-201ENST00000517127 NESP48681 1621 aa29.09■■■□□ 2.25
RNA5SP423-201ENST00000517127 HMGXB3Q12766 1538 aa29.09■■■□□ 2.25
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RNA5SP423-201ENST00000517127 SMARCA4P51532 1647 aa28.98■■■□□ 2.23
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RNA5SP423-201ENST00000517127 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
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RNA5SP423-201ENST00000517127 CADPSQ9ULU8 1353 aa28.41■■■□□ 2.14
RNA5SP423-201ENST00000517127 WDR62O43379 1518 aa28.41■■■□□ 2.14
RNA5SP423-201ENST00000517127 CEP164Q9UPV0 1460 aa28.16■■■□□ 2.1
RNA5SP423-201ENST00000517127 FANCD2Q9BXW9 1451 aa28.09■■■□□ 2.09
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RNA5SP423-201ENST00000517127 OSCARQ8IYS5 282 aa28.06■■■□□ 2.08
RNA5SP423-201ENST00000517127 CFTRP13569 1480 aa28■■■□□ 2.07
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RNA5SP423-201ENST00000517127 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa27.84■■■□□ 2.05
RNA5SP423-201ENST00000517127 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa27.84■■■□□ 2.05
RNA5SP423-201ENST00000517127 ARHGEF11O15085 1522 aa27.72■■■□□ 2.03
RNA5SP423-201ENST00000517127 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP27.72■■■□□ 2.03
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RNA5SP423-201ENST00000517127 CHD1O14646 1710 aa27.33■■□□□ 1.97
RNA5SP423-201ENST00000517127 DNMBPQ6XZF7 1577 aa27.33■■□□□ 1.97
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RNA5SP423-201ENST00000517127 GAPVD1Q14C86 1478 aa26.81■■□□□ 1.88
RNA5SP423-201ENST00000517127 PBRM1Q86U86 1689 aa26.66■■□□□ 1.86
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RNA5SP423-201ENST00000517127 NUP160Q12769 1436 aa26.51■■□□□ 1.83
RNA5SP423-201ENST00000517127 CEP170Q5SW79 1584 aa26.5■■□□□ 1.83
RNA5SP423-201ENST00000517127 ADAMTS12P58397 1594 aa26.46■■□□□ 1.83
RNA5SP423-201ENST00000517127 SHROOM2Q13796 1616 aa26.44■■□□□ 1.82
RNA5SP423-201ENST00000517127 KIF13AQ9H1H9 1805 aa26.37■■□□□ 1.81
RNA5SP423-201ENST00000517127 FHAD1B1AJZ9 1412 aa26.32■■□□□ 1.8
RNA5SP423-201ENST00000517127 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP26.31■■□□□ 1.8
RNA5SP423-201ENST00000517127 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
RNA5SP423-201ENST00000517127 ERICH3Q5RHP9 1530 aa26.23■■□□□ 1.79
RNA5SP423-201ENST00000517127 ABCC10Q5T3U5 1492 aa26.21■■□□□ 1.79
RNA5SP423-201ENST00000517127 TOP2BQ02880 1626 aa26.19■■□□□ 1.78
RNA5SP423-201ENST00000517127 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa26.18■■□□□ 1.78
RNA5SP423-201ENST00000517127 MAPKBP1O60336 1514 aa26.15■■□□□ 1.78
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