Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 NSL1-203ENST00000366978 1344 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 MEGF10-202ENST00000418761 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 PDCD2L-201ENST00000246535 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TLR1Q15399 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms