Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

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Length 786 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC32.3■■■□□ 2.76
TLR1Q15399 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
TLR1Q15399 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
TLR1Q15399 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC31.6■■■□□ 2.65
TLR1Q15399 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
TLR1Q15399 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC31.32■■■□□ 2.6
TLR1Q15399 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC31.3■■■□□ 2.6
TLR1Q15399 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
TLR1Q15399 SSSCA1-205ENST00000527920 806 ntTSL 3 BASIC31.14■■■□□ 2.58
TLR1Q15399 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
TLR1Q15399 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
TLR1Q15399 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
TLR1Q15399 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
TLR1Q15399 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
TLR1Q15399 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.63■■■□□ 2.49
TLR1Q15399 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
TLR1Q15399 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
TLR1Q15399 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
TLR1Q15399 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
TLR1Q15399 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TLR1Q15399 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TLR1Q15399 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TLR1Q15399 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TLR1Q15399 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TLR1Q15399 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TLR1Q15399 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
TLR1Q15399 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
TLR1Q15399 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
TLR1Q15399 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
TLR1Q15399 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
TLR1Q15399 OLFM1-208ENST00000392991 1057 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
TLR1Q15399 TAF5L-202ENST00000366674 492 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
TLR1Q15399 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
TLR1Q15399 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
TLR1Q15399 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
TLR1Q15399 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
TLR1Q15399 CACNG8-202ENST00000638874 1278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
TLR1Q15399 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TLR1Q15399 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TLR1Q15399 MPND-201ENST00000262966 1567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
TLR1Q15399 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
TLR1Q15399 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
TLR1Q15399 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
TLR1Q15399 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
TLR1Q15399 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TLR1Q15399 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TLR1Q15399 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TLR1Q15399 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
TLR1Q15399 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
TLR1Q15399 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
TLR1Q15399 GIPC1-205ENST00000586027 1386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
TLR1Q15399 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
TLR1Q15399 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
TLR1Q15399 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TLR1Q15399 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
TLR1Q15399 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
TLR1Q15399 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
TLR1Q15399 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
TLR1Q15399 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
TLR1Q15399 SLC25A28-201ENST00000370495 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
TLR1Q15399 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
TLR1Q15399 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
TLR1Q15399 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
TLR1Q15399 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
TLR1Q15399 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
TLR1Q15399 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
TLR1Q15399 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
TLR1Q15399 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
TLR1Q15399 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TLR1Q15399 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
TLR1Q15399 PWWP2B-202ENST00000631148 2013 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
TLR1Q15399 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
TLR1Q15399 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
TLR1Q15399 CYBA-201ENST00000261623 797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
TLR1Q15399 UBE2M-201ENST00000253023 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
TLR1Q15399 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TLR1Q15399 NT5DC2-202ENST00000422318 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
TLR1Q15399 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
TLR1Q15399 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
TLR1Q15399 CSNK1E-206ENST00000413574 1631 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
TLR1Q15399 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
TLR1Q15399 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
TLR1Q15399 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
TLR1Q15399 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
TLR1Q15399 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
TLR1Q15399 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
TLR1Q15399 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
TLR1Q15399 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
TLR1Q15399 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
TLR1Q15399 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
TLR1Q15399 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
TLR1Q15399 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
TLR1Q15399 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
TLR1Q15399 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
TLR1Q15399 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TLR1Q15399 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
TLR1Q15399 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
TLR1Q15399 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
TLR1Q15399 FEZF2-203ENST00000486811 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
TLR1Q15399 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
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