Protein–RNA interactions for Protein: P01130

LDLR, Low-density lipoprotein receptor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LDLRP01130 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDLRP01130 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDLRP01130 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDLRP01130 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDLRP01130 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDLRP01130 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDLRP01130 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LDLRP01130 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDLRP01130 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDLRP01130 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDLRP01130 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDLRP01130 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDLRP01130 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDLRP01130 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDLRP01130 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDLRP01130 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDLRP01130 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDLRP01130 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDLRP01130 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDLRP01130 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDLRP01130 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
LDLRP01130 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDLRP01130 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LDLRP01130 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 REEP3-201ENST00000373758 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
LDLRP01130 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 HGNC:18790-203ENST00000433139 2254 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
LDLRP01130 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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