Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPBO95292 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPBO95292 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPBO95292 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPBO95292 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPBO95292 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPBO95292 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
VAPBO95292 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPBO95292 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPBO95292 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPBO95292 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPBO95292 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPBO95292 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPBO95292 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPBO95292 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPBO95292 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPBO95292 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPBO95292 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPBO95292 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPBO95292 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPBO95292 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPBO95292 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPBO95292 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPBO95292 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPBO95292 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPBO95292 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPBO95292 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPBO95292 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPBO95292 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPBO95292 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPBO95292 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPBO95292 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPBO95292 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPBO95292 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPBO95292 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPBO95292 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPBO95292 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPBO95292 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
VAPBO95292 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 FAM218A-201ENST00000513876 2175 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 LFNG-204ENST00000402045 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 RFX1-201ENST00000254325 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
VAPBO95292 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPBO95292 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPBO95292 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
VAPBO95292 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms