Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 PLSCR4-203ENST00000433593 2839 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 USP49-203ENST00000394253 9034 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 SLC37A4-202ENST00000357590 2356 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 C4B-201ENST00000425700 5237 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 SLC25A29-208ENST00000554912 5169 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 GMPR2-231ENST00000620807 1910 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 ARL13B-210ENST00000535334 3906 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 DRD2-210ENST00000544518 2473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 SATB2-201ENST00000260926 5318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 KRTAP10-4-201ENST00000400374 1643 ntAPPRIS P2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 BRPF3-201ENST00000339717 4820 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 NR1H3-217ENST00000467728 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 PHF8-202ENST00000338154 6062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 PGLYRP4-202ENST00000368739 2116 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 AC025594.2-201ENST00000609480 3902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 SLIT3-206ENST00000519560 9706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 GEM-201ENST00000297596 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 SEMA3F-201ENST00000002829 3802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 ICOSLG-202ENST00000400377 2907 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 KIAA0930-201ENST00000251993 2723 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 DPP3-211ENST00000532677 3078 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 TNFSF13-203ENST00000380535 2195 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 CXCR5-201ENST00000292174 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 ANKHD1-203ENST00000360839 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 FBRSL1-205ENST00000542061 3175 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 TRMT2B-202ENST00000372936 3327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 SNPH-201ENST00000381867 5533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC11.4□□□□□ -0.58
SNHG12Q9BXW3 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms