Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

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Length 1,325 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 PPP1R21-201ENST00000281394 3137 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 HPCAL1-202ENST00000381765 1904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 MTX3-201ENST00000509852 1655 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 PLD3-204ENST00000409281 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 ATE1-209ENST00000543447 4826 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 CAAP1-206ENST00000625311 1532 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
ZBED9Q6R2W3 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
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