Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 SETD6-203ENST00000394266 3423 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 LLGL1-201ENST00000316843 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 USP44-203ENST00000537435 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 SPTSSB-201ENST00000359175 3103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 RAB11FIP1-201ENST00000287263 6253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 FOXD4L5-201ENST00000377420 3109 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 NLRP7-209ENST00000592784 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 C1QTNF1-203ENST00000354124 2714 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 LIG1-202ENST00000427526 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 CD22-209ENST00000594250 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
GABPB1Q06547 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms