Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 MAPKAPK5-207ENST00000551404 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 MFGE8-215ENST00000566497 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.13
CACNG1Q06432 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 MLF1-206ENST00000471745 1266 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 CERNA1-202ENST00000560518 1972 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
CACNG1Q06432 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms