Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D5

NXF3, Nuclear RNA export factor 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NXF3Q9H4D5 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NXF3Q9H4D5 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NXF3Q9H4D5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NXF3Q9H4D5 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NXF3Q9H4D5 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NXF3Q9H4D5 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NXF3Q9H4D5 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NXF3Q9H4D5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NXF3Q9H4D5 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NXF3Q9H4D5 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NXF3Q9H4D5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NXF3Q9H4D5 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NXF3Q9H4D5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NXF3Q9H4D5 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NXF3Q9H4D5 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NXF3Q9H4D5 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NXF3Q9H4D5 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NXF3Q9H4D5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NXF3Q9H4D5 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NXF3Q9H4D5 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NXF3Q9H4D5 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NXF3Q9H4D5 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NXF3Q9H4D5 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NXF3Q9H4D5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NXF3Q9H4D5 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NXF3Q9H4D5 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NXF3Q9H4D5 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NXF3Q9H4D5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NXF3Q9H4D5 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NXF3Q9H4D5 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NXF3Q9H4D5 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NXF3Q9H4D5 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NXF3Q9H4D5 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms