Protein–RNA interactions for Protein: Q9H3U5

MFSD1, Major facilitator superfamily domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD1Q9H3U5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MFSD1Q9H3U5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MFSD1Q9H3U5 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MFSD1Q9H3U5 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MFSD1Q9H3U5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MFSD1Q9H3U5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MFSD1Q9H3U5 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MFSD1Q9H3U5 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MFSD1Q9H3U5 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MFSD1Q9H3U5 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MFSD1Q9H3U5 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MFSD1Q9H3U5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MFSD1Q9H3U5 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MFSD1Q9H3U5 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MFSD1Q9H3U5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MFSD1Q9H3U5 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms