Protein–RNA interactions for Protein: Q9BT88

SYT11, Synaptotagmin-11, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT11Q9BT88 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SYT11Q9BT88 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SYT11Q9BT88 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SYT11Q9BT88 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SYT11Q9BT88 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms