Protein–RNA interactions for Protein: Q99816

TSG101, Tumor susceptibility gene 101 protein, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSG101Q99816 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSG101Q99816 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TSG101Q99816 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSG101Q99816 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TSG101Q99816 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSG101Q99816 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSG101Q99816 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TSG101Q99816 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSG101Q99816 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSG101Q99816 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSG101Q99816 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSG101Q99816 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSG101Q99816 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSG101Q99816 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TSG101Q99816 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSG101Q99816 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSG101Q99816 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSG101Q99816 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSG101Q99816 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSG101Q99816 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TSG101Q99816 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TSG101Q99816 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSG101Q99816 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSG101Q99816 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TSG101Q99816 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TSG101Q99816 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TSG101Q99816 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
TSG101Q99816 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSG101Q99816 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSG101Q99816 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSG101Q99816 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSG101Q99816 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TSG101Q99816 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TSG101Q99816 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSG101Q99816 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSG101Q99816 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSG101Q99816 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSG101Q99816 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSG101Q99816 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSG101Q99816 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TSG101Q99816 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSG101Q99816 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSG101Q99816 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSG101Q99816 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSG101Q99816 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSG101Q99816 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSG101Q99816 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
TSG101Q99816 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TSG101Q99816 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TSG101Q99816 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSG101Q99816 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSG101Q99816 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TSG101Q99816 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
TSG101Q99816 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSG101Q99816 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSG101Q99816 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSG101Q99816 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSG101Q99816 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TSG101Q99816 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSG101Q99816 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSG101Q99816 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSG101Q99816 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TSG101Q99816 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
TSG101Q99816 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TSG101Q99816 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms