Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
COPS8Q99627 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
COPS8Q99627 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
COPS8Q99627 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms