Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND23

CARMIL3, Capping protein, Arp2/3 and myosin-I linker protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CARMIL3Q8ND23 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CARMIL3Q8ND23 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CARMIL3Q8ND23 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CARMIL3Q8ND23 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CARMIL3Q8ND23 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
CARMIL3Q8ND23 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
CARMIL3Q8ND23 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
CARMIL3Q8ND23 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL3Q8ND23 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL3Q8ND23 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL3Q8ND23 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL3Q8ND23 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL3Q8ND23 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL3Q8ND23 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL3Q8ND23 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CARMIL3Q8ND23 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CARMIL3Q8ND23 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CARMIL3Q8ND23 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CARMIL3Q8ND23 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
CARMIL3Q8ND23 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CARMIL3Q8ND23 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CARMIL3Q8ND23 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CARMIL3Q8ND23 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
CARMIL3Q8ND23 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARMIL3Q8ND23 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARMIL3Q8ND23 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARMIL3Q8ND23 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CARMIL3Q8ND23 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CARMIL3Q8ND23 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARMIL3Q8ND23 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARMIL3Q8ND23 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARMIL3Q8ND23 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARMIL3Q8ND23 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CARMIL3Q8ND23 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CARMIL3Q8ND23 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
CARMIL3Q8ND23 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CARMIL3Q8ND23 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CARMIL3Q8ND23 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARMIL3Q8ND23 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARMIL3Q8ND23 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CARMIL3Q8ND23 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL3Q8ND23 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL3Q8ND23 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL3Q8ND23 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL3Q8ND23 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL3Q8ND23 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CARMIL3Q8ND23 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
CARMIL3Q8ND23 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
CARMIL3Q8ND23 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
CARMIL3Q8ND23 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL3Q8ND23 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL3Q8ND23 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL3Q8ND23 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL3Q8ND23 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL3Q8ND23 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL3Q8ND23 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
CARMIL3Q8ND23 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CARMIL3Q8ND23 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CARMIL3Q8ND23 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
CARMIL3Q8ND23 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms