Protein–RNA interactions for Protein: Q8IW40

CCDC103, Coiled-coil domain-containing protein 103, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC103Q8IW40 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CCDC103Q8IW40 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC103Q8IW40 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC103Q8IW40 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms