Protein–RNA interactions for Protein: Q4VNC1

ATP13A4, Probable cation-transporting ATPase 13A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A4Q4VNC1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATP13A4Q4VNC1 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATP13A4Q4VNC1 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATP13A4Q4VNC1 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP13A4Q4VNC1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP13A4Q4VNC1 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms