Protein–RNA interactions for Protein: Q16563

SYPL1, Synaptophysin-like protein 1, humanhuman

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Length 259 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYPL1Q16563 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SYPL1Q16563 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SYPL1Q16563 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYPL1Q16563 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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