Protein–RNA interactions for Protein: Q15293

RCN1, Reticulocalbin-1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN1Q15293 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RCN1Q15293 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
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RCN1Q15293 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
RCN1Q15293 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
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RCN1Q15293 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
RCN1Q15293 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
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RCN1Q15293 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
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RCN1Q15293 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCN1Q15293 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCN1Q15293 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCN1Q15293 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
RCN1Q15293 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCN1Q15293 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
RCN1Q15293 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCN1Q15293 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCN1Q15293 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
RCN1Q15293 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCN1Q15293 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
RCN1Q15293 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCN1Q15293 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCN1Q15293 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCN1Q15293 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCN1Q15293 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCN1Q15293 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCN1Q15293 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
RCN1Q15293 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCN1Q15293 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCN1Q15293 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
RCN1Q15293 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
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