Protein–RNA interactions for Protein: Q15293

RCN1, Reticulocalbin-1, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN1Q15293 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.07■■■□□ 2.88
RCN1Q15293 SEPT3-204ENST00000406029 1866 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
RCN1Q15293 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
RCN1Q15293 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
RCN1Q15293 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
RCN1Q15293 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
RCN1Q15293 TCF15-201ENST00000246080 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
RCN1Q15293 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC31.14■■■□□ 2.57
RCN1Q15293 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
RCN1Q15293 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
RCN1Q15293 HES6-203ENST00000409160 1600 ntTSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
RCN1Q15293 CYHR1-209ENST00000530374 1870 ntTSL 3 BASIC30.95■■■□□ 2.55
RCN1Q15293 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
RCN1Q15293 PRR5-217ENST00000617066 1726 ntTSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
RCN1Q15293 FAM149A-205ENST00000502970 1990 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.57■■■□□ 2.48
RCN1Q15293 ZNF358-202ENST00000597229 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
RCN1Q15293 FBLL1-201ENST00000338333 1519 ntAPPRIS P1 BASIC30.35■■■□□ 2.45
RCN1Q15293 AL356512.1-201ENST00000607453 1739 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
RCN1Q15293 PRR5-216ENST00000611394 1843 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
RCN1Q15293 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
RCN1Q15293 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RCN1Q15293 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RCN1Q15293 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
RCN1Q15293 CSNK1E-204ENST00000403904 1580 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
RCN1Q15293 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.81■■■□□ 2.36
RCN1Q15293 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
RCN1Q15293 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
RCN1Q15293 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
RCN1Q15293 C11orf84-201ENST00000294244 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
RCN1Q15293 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
RCN1Q15293 NECTIN3-201ENST00000319792 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
RCN1Q15293 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RCN1Q15293 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
RCN1Q15293 PHF10-201ENST00000339209 1719 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
RCN1Q15293 MPND-207ENST00000599840 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
RCN1Q15293 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RCN1Q15293 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
RCN1Q15293 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
RCN1Q15293 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
RCN1Q15293 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
RCN1Q15293 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
RCN1Q15293 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
RCN1Q15293 PTF1A-201ENST00000376504 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
RCN1Q15293 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
RCN1Q15293 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
RCN1Q15293 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
RCN1Q15293 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
RCN1Q15293 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
RCN1Q15293 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
RCN1Q15293 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RCN1Q15293 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RCN1Q15293 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RCN1Q15293 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RCN1Q15293 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
RCN1Q15293 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RCN1Q15293 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RCN1Q15293 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RCN1Q15293 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
RCN1Q15293 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
RCN1Q15293 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
RCN1Q15293 PPP1CA-203ENST00000376745 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
RCN1Q15293 MAPK3-202ENST00000322266 1743 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
RCN1Q15293 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
RCN1Q15293 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
RCN1Q15293 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
RCN1Q15293 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
RCN1Q15293 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
RCN1Q15293 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
RCN1Q15293 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
RCN1Q15293 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
RCN1Q15293 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
RCN1Q15293 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
RCN1Q15293 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RCN1Q15293 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
RCN1Q15293 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
RCN1Q15293 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
RCN1Q15293 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RCN1Q15293 NT5DC2-203ENST00000459839 1639 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
RCN1Q15293 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
RCN1Q15293 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
RCN1Q15293 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
RCN1Q15293 METRNL-201ENST00000320095 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
RCN1Q15293 HAGHL-201ENST00000341413 1701 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
RCN1Q15293 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
RCN1Q15293 ZFYVE21-201ENST00000216602 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
RCN1Q15293 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RCN1Q15293 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
RCN1Q15293 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
RCN1Q15293 ILK-212ENST00000532063 1617 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
RCN1Q15293 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
RCN1Q15293 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
RCN1Q15293 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
RCN1Q15293 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
RCN1Q15293 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
RCN1Q15293 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
RCN1Q15293 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
RCN1Q15293 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RCN1Q15293 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
RCN1Q15293 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
RCN1Q15293 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
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