Protein–RNA interactions for Protein: Q14159

SPIDR, DNA repair-scaffolding protein, humanhuman

Predictions only

Length 915 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIDRQ14159 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
SPIDRQ14159 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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SPIDRQ14159 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
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SPIDRQ14159 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
SPIDRQ14159 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
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SPIDRQ14159 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
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SPIDRQ14159 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SPIDRQ14159 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
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