Protein–RNA interactions for Protein: Q13129

RLF, Zinc finger protein Rlf, humanhuman

Predictions only

Length 1,914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLFQ13129 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RLFQ13129 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RLFQ13129 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
RLFQ13129 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RLFQ13129 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RLFQ13129 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RLFQ13129 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
RLFQ13129 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
RLFQ13129 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
RLFQ13129 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RLFQ13129 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RLFQ13129 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RLFQ13129 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RLFQ13129 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RLFQ13129 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
RLFQ13129 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
RLFQ13129 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RLFQ13129 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
RLFQ13129 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RLFQ13129 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
RLFQ13129 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RLFQ13129 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
RLFQ13129 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RLFQ13129 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
RLFQ13129 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RLFQ13129 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RLFQ13129 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RLFQ13129 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RLFQ13129 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
RLFQ13129 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
RLFQ13129 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
RLFQ13129 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RLFQ13129 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RLFQ13129 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RLFQ13129 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RLFQ13129 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
RLFQ13129 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
RLFQ13129 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RLFQ13129 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RLFQ13129 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
RLFQ13129 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RLFQ13129 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
RLFQ13129 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RLFQ13129 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
RLFQ13129 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RLFQ13129 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RLFQ13129 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RLFQ13129 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
RLFQ13129 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RLFQ13129 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RLFQ13129 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RLFQ13129 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RLFQ13129 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
RLFQ13129 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RLFQ13129 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
RLFQ13129 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RLFQ13129 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RLFQ13129 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
RLFQ13129 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RLFQ13129 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
RLFQ13129 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RLFQ13129 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RLFQ13129 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.93
RLFQ13129 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
RLFQ13129 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RLFQ13129 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
RLFQ13129 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
RLFQ13129 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RLFQ13129 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
RLFQ13129 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RLFQ13129 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RLFQ13129 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
RLFQ13129 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
RLFQ13129 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RLFQ13129 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RLFQ13129 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RLFQ13129 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RLFQ13129 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RLFQ13129 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RLFQ13129 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RLFQ13129 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
RLFQ13129 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
RLFQ13129 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
RLFQ13129 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RLFQ13129 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RLFQ13129 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RLFQ13129 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RLFQ13129 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RLFQ13129 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RLFQ13129 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
RLFQ13129 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RLFQ13129 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
RLFQ13129 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RLFQ13129 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RLFQ13129 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RLFQ13129 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
RLFQ13129 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RLFQ13129 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
RLFQ13129 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
RLFQ13129 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.92
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