Protein–RNA interactions for Protein: Q09428

ABCC8, ATP-binding cassette sub-family C member 8, humanhuman

Predictions only

Length 1,581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC8Q09428 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
ABCC8Q09428 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
ABCC8Q09428 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
ABCC8Q09428 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
ABCC8Q09428 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
ABCC8Q09428 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.1
ABCC8Q09428 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
ABCC8Q09428 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC40.69■■■■■ 4.1
ABCC8Q09428 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.69■■■■■ 4.1
ABCC8Q09428 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
ABCC8Q09428 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
ABCC8Q09428 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
ABCC8Q09428 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
ABCC8Q09428 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC40.68■■■■■ 4.1
ABCC8Q09428 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC40.68■■■■■ 4.1
ABCC8Q09428 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC40.68■■■■■ 4.1
ABCC8Q09428 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.68■■■■■ 4.1
ABCC8Q09428 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
ABCC8Q09428 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
ABCC8Q09428 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
ABCC8Q09428 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC40.67■■■■■ 4.1
ABCC8Q09428 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
ABCC8Q09428 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.66■■■■■ 4.1
ABCC8Q09428 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC40.66■■■■■ 4.1
ABCC8Q09428 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
ABCC8Q09428 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
ABCC8Q09428 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC40.65■■■■■ 4.1
ABCC8Q09428 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC40.65■■■■■ 4.1
ABCC8Q09428 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
ABCC8Q09428 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC40.64■■■■■ 4.1
ABCC8Q09428 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
ABCC8Q09428 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.64■■■■■ 4.1
ABCC8Q09428 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC40.63■■■■■ 4.09
ABCC8Q09428 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
ABCC8Q09428 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
ABCC8Q09428 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC40.62■■■■■ 4.09
ABCC8Q09428 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC40.62■■■■■ 4.09
ABCC8Q09428 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
ABCC8Q09428 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
ABCC8Q09428 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
ABCC8Q09428 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.61■■■■■ 4.09
ABCC8Q09428 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC40.61■■■■■ 4.09
ABCC8Q09428 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC40.61■■■■■ 4.09
ABCC8Q09428 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
ABCC8Q09428 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
ABCC8Q09428 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC40.6■■■■■ 4.09
ABCC8Q09428 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC40.6■■■■■ 4.09
ABCC8Q09428 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC40.6■■■■■ 4.09
ABCC8Q09428 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
ABCC8Q09428 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.6■■■■■ 4.09
ABCC8Q09428 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
ABCC8Q09428 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.59■■■■■ 4.09
ABCC8Q09428 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC40.58■■■■■ 4.09
ABCC8Q09428 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
ABCC8Q09428 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC40.58■■■■■ 4.09
ABCC8Q09428 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
ABCC8Q09428 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.57■■■■■ 4.09
ABCC8Q09428 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC40.57■■■■■ 4.09
ABCC8Q09428 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.09
ABCC8Q09428 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.09
ABCC8Q09428 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
ABCC8Q09428 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.57■■■■■ 4.08
ABCC8Q09428 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC40.57■■■■■ 4.08
ABCC8Q09428 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.56■■■■■ 4.08
ABCC8Q09428 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
ABCC8Q09428 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
ABCC8Q09428 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
ABCC8Q09428 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
ABCC8Q09428 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.55■■■■■ 4.08
ABCC8Q09428 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.54■■■■■ 4.08
ABCC8Q09428 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC40.54■■■■■ 4.08
ABCC8Q09428 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC40.54■■■■■ 4.08
ABCC8Q09428 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.53■■■■■ 4.08
ABCC8Q09428 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
ABCC8Q09428 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC40.52■■■■■ 4.08
ABCC8Q09428 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.52■■■■■ 4.08
ABCC8Q09428 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC40.51■■■■■ 4.08
ABCC8Q09428 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
ABCC8Q09428 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC40.51■■■■■ 4.07
ABCC8Q09428 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC40.5■■■■■ 4.07
ABCC8Q09428 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC40.5■■■■■ 4.07
ABCC8Q09428 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
ABCC8Q09428 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC40.5■■■■■ 4.07
ABCC8Q09428 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.49■■■■■ 4.07
ABCC8Q09428 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.49■■■■■ 4.07
ABCC8Q09428 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC40.48■■■■■ 4.07
ABCC8Q09428 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
ABCC8Q09428 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
ABCC8Q09428 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
ABCC8Q09428 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
ABCC8Q09428 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
ABCC8Q09428 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
ABCC8Q09428 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC40.48■■■■■ 4.07
ABCC8Q09428 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
ABCC8Q09428 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.48■■■■■ 4.07
ABCC8Q09428 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC40.47■■■■■ 4.07
ABCC8Q09428 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC40.46■■■■■ 4.07
ABCC8Q09428 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
ABCC8Q09428 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.46■■■■■ 4.07
ABCC8Q09428 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC40.46■■■■■ 4.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms