Protein–RNA interactions for Protein: Q08945

SSRP1, FACT complex subunit SSRP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSRP1Q08945 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SSRP1Q08945 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SSRP1Q08945 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.2■■□□□ 1.95
SSRP1Q08945 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SSRP1Q08945 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms