Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GABPAQ06546 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GABPAQ06546 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GABPAQ06546 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GABPAQ06546 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GABPAQ06546 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GABPAQ06546 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GABPAQ06546 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GABPAQ06546 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GABPAQ06546 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GABPAQ06546 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GABPAQ06546 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
GABPAQ06546 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GABPAQ06546 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GABPAQ06546 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GABPAQ06546 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GABPAQ06546 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GABPAQ06546 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GABPAQ06546 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GABPAQ06546 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GABPAQ06546 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GABPAQ06546 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GABPAQ06546 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GABPAQ06546 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GABPAQ06546 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GABPAQ06546 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GABPAQ06546 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
GABPAQ06546 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
GABPAQ06546 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GABPAQ06546 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GABPAQ06546 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GABPAQ06546 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GABPAQ06546 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GABPAQ06546 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GABPAQ06546 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GABPAQ06546 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GABPAQ06546 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GABPAQ06546 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
GABPAQ06546 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
GABPAQ06546 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
GABPAQ06546 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
GABPAQ06546 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GABPAQ06546 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
GABPAQ06546 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
GABPAQ06546 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
GABPAQ06546 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GABPAQ06546 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
GABPAQ06546 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
GABPAQ06546 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GABPAQ06546 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
GABPAQ06546 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
GABPAQ06546 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
GABPAQ06546 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GABPAQ06546 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GABPAQ06546 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GABPAQ06546 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
GABPAQ06546 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
GABPAQ06546 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GABPAQ06546 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GABPAQ06546 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GABPAQ06546 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
GABPAQ06546 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GABPAQ06546 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GABPAQ06546 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
GABPAQ06546 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GABPAQ06546 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GABPAQ06546 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GABPAQ06546 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GABPAQ06546 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GABPAQ06546 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GABPAQ06546 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GABPAQ06546 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
GABPAQ06546 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
GABPAQ06546 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
GABPAQ06546 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GABPAQ06546 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
GABPAQ06546 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
GABPAQ06546 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
GABPAQ06546 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GABPAQ06546 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
GABPAQ06546 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
GABPAQ06546 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GABPAQ06546 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GABPAQ06546 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
GABPAQ06546 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
GABPAQ06546 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GABPAQ06546 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
GABPAQ06546 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
GABPAQ06546 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
GABPAQ06546 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
GABPAQ06546 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GABPAQ06546 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GABPAQ06546 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GABPAQ06546 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GABPAQ06546 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GABPAQ06546 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GABPAQ06546 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
GABPAQ06546 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
GABPAQ06546 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
GABPAQ06546 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms