Protein–RNA interactions for Protein: Q02818

NUCB1, Nucleobindin-1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB1Q02818 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUCB1Q02818 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUCB1Q02818 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUCB1Q02818 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUCB1Q02818 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUCB1Q02818 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NUCB1Q02818 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUCB1Q02818 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUCB1Q02818 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUCB1Q02818 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NUCB1Q02818 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUCB1Q02818 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUCB1Q02818 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NUCB1Q02818 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NUCB1Q02818 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUCB1Q02818 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUCB1Q02818 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NUCB1Q02818 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NUCB1Q02818 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
NUCB1Q02818 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NUCB1Q02818 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NUCB1Q02818 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
NUCB1Q02818 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NUCB1Q02818 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NUCB1Q02818 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NUCB1Q02818 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
NUCB1Q02818 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
NUCB1Q02818 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NUCB1Q02818 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NUCB1Q02818 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
NUCB1Q02818 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUCB1Q02818 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUCB1Q02818 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUCB1Q02818 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUCB1Q02818 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUCB1Q02818 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
NUCB1Q02818 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUCB1Q02818 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUCB1Q02818 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUCB1Q02818 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUCB1Q02818 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
NUCB1Q02818 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUCB1Q02818 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUCB1Q02818 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
NUCB1Q02818 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
NUCB1Q02818 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUCB1Q02818 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUCB1Q02818 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUCB1Q02818 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUCB1Q02818 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUCB1Q02818 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUCB1Q02818 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUCB1Q02818 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
NUCB1Q02818 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NUCB1Q02818 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
NUCB1Q02818 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms