Protein–RNA interactions for Protein: Q02548

PAX5, Paired box protein Pax-5, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAX5Q02548 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PAX5Q02548 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PAX5Q02548 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
PAX5Q02548 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PAX5Q02548 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PAX5Q02548 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PAX5Q02548 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PAX5Q02548 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
PAX5Q02548 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
PAX5Q02548 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PAX5Q02548 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
PAX5Q02548 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PAX5Q02548 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
PAX5Q02548 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms