Protein–RNA interactions for Protein: Q00013

MPP1, 55 kDa erythrocyte membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MPP1Q00013 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MPP1Q00013 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MPP1Q00013 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MPP1Q00013 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MPP1Q00013 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MPP1Q00013 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MPP1Q00013 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MPP1Q00013 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MPP1Q00013 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MPP1Q00013 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MPP1Q00013 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MPP1Q00013 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
MPP1Q00013 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MPP1Q00013 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MPP1Q00013 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
MPP1Q00013 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MPP1Q00013 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MPP1Q00013 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MPP1Q00013 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MPP1Q00013 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MPP1Q00013 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
MPP1Q00013 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MPP1Q00013 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
MPP1Q00013 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MPP1Q00013 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
MPP1Q00013 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
MPP1Q00013 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
MPP1Q00013 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms