Protein–RNA interactions for Protein: P57087

JAM2, Junctional adhesion molecule B, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAM2P57087 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
JAM2P57087 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
JAM2P57087 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
JAM2P57087 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
JAM2P57087 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
JAM2P57087 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
JAM2P57087 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
JAM2P57087 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
JAM2P57087 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
JAM2P57087 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
JAM2P57087 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
JAM2P57087 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
JAM2P57087 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
JAM2P57087 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
JAM2P57087 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
JAM2P57087 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
JAM2P57087 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
JAM2P57087 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
JAM2P57087 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
JAM2P57087 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
JAM2P57087 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
JAM2P57087 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
JAM2P57087 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
JAM2P57087 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
JAM2P57087 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
JAM2P57087 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
JAM2P57087 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
JAM2P57087 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
JAM2P57087 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
JAM2P57087 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
JAM2P57087 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
JAM2P57087 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
JAM2P57087 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
JAM2P57087 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
JAM2P57087 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
JAM2P57087 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
JAM2P57087 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
JAM2P57087 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
JAM2P57087 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
JAM2P57087 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
JAM2P57087 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
JAM2P57087 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
JAM2P57087 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
JAM2P57087 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
JAM2P57087 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
JAM2P57087 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
JAM2P57087 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
JAM2P57087 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
JAM2P57087 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
JAM2P57087 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
JAM2P57087 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
JAM2P57087 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
JAM2P57087 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
JAM2P57087 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
JAM2P57087 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
JAM2P57087 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
JAM2P57087 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
JAM2P57087 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
JAM2P57087 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
JAM2P57087 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
JAM2P57087 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
JAM2P57087 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
JAM2P57087 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
JAM2P57087 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
JAM2P57087 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
JAM2P57087 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
JAM2P57087 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
JAM2P57087 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
JAM2P57087 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
JAM2P57087 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
JAM2P57087 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
JAM2P57087 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
JAM2P57087 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
JAM2P57087 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
JAM2P57087 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
JAM2P57087 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
JAM2P57087 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
JAM2P57087 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
JAM2P57087 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
JAM2P57087 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
JAM2P57087 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
JAM2P57087 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
JAM2P57087 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
JAM2P57087 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
JAM2P57087 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
JAM2P57087 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
JAM2P57087 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
JAM2P57087 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
JAM2P57087 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
JAM2P57087 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
JAM2P57087 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
JAM2P57087 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
JAM2P57087 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
JAM2P57087 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
JAM2P57087 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
JAM2P57087 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
JAM2P57087 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
JAM2P57087 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
JAM2P57087 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
JAM2P57087 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms