Protein–RNA interactions for Protein: P33151

CDH5, Cadherin-5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH5P33151 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH5P33151 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CDH5P33151 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH5P33151 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH5P33151 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH5P33151 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH5P33151 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH5P33151 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH5P33151 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH5P33151 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH5P33151 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH5P33151 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH5P33151 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CDH5P33151 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH5P33151 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH5P33151 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH5P33151 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH5P33151 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH5P33151 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH5P33151 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH5P33151 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH5P33151 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CDH5P33151 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH5P33151 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH5P33151 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH5P33151 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH5P33151 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CDH5P33151 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH5P33151 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH5P33151 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH5P33151 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH5P33151 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH5P33151 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH5P33151 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH5P33151 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CDH5P33151 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH5P33151 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH5P33151 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH5P33151 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH5P33151 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH5P33151 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH5P33151 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH5P33151 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH5P33151 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH5P33151 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH5P33151 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH5P33151 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CDH5P33151 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH5P33151 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH5P33151 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH5P33151 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH5P33151 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH5P33151 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH5P33151 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CDH5P33151 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH5P33151 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH5P33151 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH5P33151 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH5P33151 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CDH5P33151 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH5P33151 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH5P33151 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH5P33151 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH5P33151 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH5P33151 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH5P33151 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH5P33151 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH5P33151 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH5P33151 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CDH5P33151 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH5P33151 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH5P33151 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH5P33151 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH5P33151 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CDH5P33151 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH5P33151 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH5P33151 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH5P33151 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH5P33151 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH5P33151 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH5P33151 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH5P33151 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH5P33151 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CDH5P33151 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH5P33151 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH5P33151 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH5P33151 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH5P33151 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH5P33151 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH5P33151 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CDH5P33151 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH5P33151 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH5P33151 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH5P33151 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH5P33151 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH5P33151 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH5P33151 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH5P33151 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CDH5P33151 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CDH5P33151 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms