Protein–RNA interactions for Protein: P31270

HOXA11, Homeobox protein Hox-A11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA11P31270 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
HOXA11P31270 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
HOXA11P31270 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA11P31270 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA11P31270 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA11P31270 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA11P31270 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA11P31270 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA11P31270 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA11P31270 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
HOXA11P31270 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA11P31270 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
HOXA11P31270 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA11P31270 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA11P31270 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA11P31270 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA11P31270 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA11P31270 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA11P31270 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA11P31270 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
HOXA11P31270 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
HOXA11P31270 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA11P31270 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA11P31270 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA11P31270 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
HOXA11P31270 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA11P31270 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA11P31270 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA11P31270 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA11P31270 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
HOXA11P31270 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA11P31270 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA11P31270 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA11P31270 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA11P31270 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA11P31270 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA11P31270 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
HOXA11P31270 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA11P31270 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA11P31270 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA11P31270 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA11P31270 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA11P31270 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA11P31270 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA11P31270 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA11P31270 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
HOXA11P31270 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA11P31270 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA11P31270 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA11P31270 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA11P31270 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA11P31270 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
HOXA11P31270 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA11P31270 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA11P31270 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
HOXA11P31270 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA11P31270 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA11P31270 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA11P31270 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA11P31270 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA11P31270 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
HOXA11P31270 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms