Protein–RNA interactions for Protein: P21281

ATP6V1B2, V-type proton ATPase subunit B, brain isoform, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1B2P21281 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1B2P21281 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1B2P21281 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1B2P21281 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1B2P21281 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1B2P21281 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1B2P21281 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1B2P21281 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1B2P21281 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1B2P21281 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1B2P21281 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATP6V1B2P21281 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V1B2P21281 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V1B2P21281 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V1B2P21281 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V1B2P21281 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V1B2P21281 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V1B2P21281 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V1B2P21281 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V1B2P21281 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V1B2P21281 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATP6V1B2P21281 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V1B2P21281 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V1B2P21281 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V1B2P21281 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V1B2P21281 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V1B2P21281 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V1B2P21281 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V1B2P21281 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATP6V1B2P21281 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP6V1B2P21281 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP6V1B2P21281 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP6V1B2P21281 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP6V1B2P21281 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATP6V1B2P21281 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATP6V1B2P21281 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATP6V1B2P21281 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms