Protein–RNA interactions for Protein: P08700

IL3, Interleukin-3, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL3P08700 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
IL3P08700 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IL3P08700 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
IL3P08700 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
IL3P08700 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
IL3P08700 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL3P08700 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL3P08700 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL3P08700 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL3P08700 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL3P08700 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL3P08700 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL3P08700 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL3P08700 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL3P08700 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL3P08700 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL3P08700 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL3P08700 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
IL3P08700 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL3P08700 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL3P08700 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL3P08700 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL3P08700 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL3P08700 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL3P08700 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL3P08700 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
IL3P08700 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
IL3P08700 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IL3P08700 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
IL3P08700 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IL3P08700 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
IL3P08700 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IL3P08700 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IL3P08700 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
IL3P08700 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IL3P08700 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IL3P08700 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
IL3P08700 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IL3P08700 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IL3P08700 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IL3P08700 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IL3P08700 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IL3P08700 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
IL3P08700 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IL3P08700 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IL3P08700 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IL3P08700 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IL3P08700 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IL3P08700 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IL3P08700 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IL3P08700 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IL3P08700 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IL3P08700 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IL3P08700 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
IL3P08700 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
IL3P08700 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
IL3P08700 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
IL3P08700 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IL3P08700 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IL3P08700 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IL3P08700 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
IL3P08700 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IL3P08700 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IL3P08700 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IL3P08700 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IL3P08700 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
IL3P08700 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
IL3P08700 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
IL3P08700 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IL3P08700 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IL3P08700 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
IL3P08700 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IL3P08700 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IL3P08700 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IL3P08700 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
IL3P08700 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IL3P08700 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
IL3P08700 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IL3P08700 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IL3P08700 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IL3P08700 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IL3P08700 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IL3P08700 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
IL3P08700 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
IL3P08700 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IL3P08700 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IL3P08700 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IL3P08700 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IL3P08700 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IL3P08700 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IL3P08700 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
IL3P08700 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
IL3P08700 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IL3P08700 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IL3P08700 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IL3P08700 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IL3P08700 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
IL3P08700 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
IL3P08700 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
IL3P08700 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms