Protein–RNA interactions for Protein: O95741

CPNE6, Copine-6, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE6O95741 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CPNE6O95741 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CPNE6O95741 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms