Protein–RNA interactions for Protein: O95377

GJB5, Gap junction beta-5 protein, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB5O95377 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
GJB5O95377 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GJB5O95377 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB5O95377 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB5O95377 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB5O95377 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB5O95377 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB5O95377 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB5O95377 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB5O95377 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB5O95377 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GJB5O95377 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GJB5O95377 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJB5O95377 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJB5O95377 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJB5O95377 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
GJB5O95377 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJB5O95377 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJB5O95377 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJB5O95377 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GJB5O95377 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB5O95377 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB5O95377 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB5O95377 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
GJB5O95377 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJB5O95377 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJB5O95377 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJB5O95377 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJB5O95377 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GJB5O95377 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
GJB5O95377 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJB5O95377 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJB5O95377 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GJB5O95377 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB5O95377 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB5O95377 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB5O95377 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB5O95377 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB5O95377 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB5O95377 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB5O95377 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GJB5O95377 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB5O95377 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB5O95377 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB5O95377 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB5O95377 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB5O95377 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
GJB5O95377 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
GJB5O95377 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB5O95377 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB5O95377 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB5O95377 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB5O95377 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB5O95377 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB5O95377 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
GJB5O95377 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB5O95377 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB5O95377 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB5O95377 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB5O95377 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB5O95377 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB5O95377 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB5O95377 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB5O95377 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB5O95377 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB5O95377 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
GJB5O95377 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB5O95377 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB5O95377 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
GJB5O95377 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB5O95377 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB5O95377 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB5O95377 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB5O95377 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB5O95377 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GJB5O95377 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB5O95377 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB5O95377 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB5O95377 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GJB5O95377 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB5O95377 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB5O95377 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB5O95377 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB5O95377 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GJB5O95377 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJB5O95377 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJB5O95377 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJB5O95377 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJB5O95377 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJB5O95377 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJB5O95377 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GJB5O95377 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GJB5O95377 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
GJB5O95377 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB5O95377 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB5O95377 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB5O95377 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB5O95377 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB5O95377 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GJB5O95377 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms