Protein–RNA interactions for Protein: O94769

ECM2, Extracellular matrix protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM2O94769 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
ECM2O94769 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ECM2O94769 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ECM2O94769 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ECM2O94769 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ECM2O94769 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ECM2O94769 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ECM2O94769 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ECM2O94769 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ECM2O94769 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
ECM2O94769 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ECM2O94769 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ECM2O94769 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ECM2O94769 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ECM2O94769 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ECM2O94769 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ECM2O94769 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ECM2O94769 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ECM2O94769 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ECM2O94769 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ECM2O94769 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ECM2O94769 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECM2O94769 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECM2O94769 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECM2O94769 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECM2O94769 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECM2O94769 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ECM2O94769 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ECM2O94769 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ECM2O94769 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ECM2O94769 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ECM2O94769 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ECM2O94769 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ECM2O94769 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ECM2O94769 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ECM2O94769 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ECM2O94769 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
ECM2O94769 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ECM2O94769 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ECM2O94769 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
ECM2O94769 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ECM2O94769 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ECM2O94769 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ECM2O94769 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ECM2O94769 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ECM2O94769 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ECM2O94769 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ECM2O94769 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ECM2O94769 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ECM2O94769 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ECM2O94769 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ECM2O94769 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ECM2O94769 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ECM2O94769 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ECM2O94769 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ECM2O94769 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ECM2O94769 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ECM2O94769 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ECM2O94769 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ECM2O94769 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ECM2O94769 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ECM2O94769 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ECM2O94769 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ECM2O94769 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ECM2O94769 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ECM2O94769 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ECM2O94769 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ECM2O94769 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ECM2O94769 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ECM2O94769 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ECM2O94769 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ECM2O94769 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ECM2O94769 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ECM2O94769 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ECM2O94769 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ECM2O94769 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ECM2O94769 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ECM2O94769 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ECM2O94769 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ECM2O94769 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ECM2O94769 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ECM2O94769 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ECM2O94769 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ECM2O94769 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ECM2O94769 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ECM2O94769 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ECM2O94769 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ECM2O94769 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ECM2O94769 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ECM2O94769 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ECM2O94769 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ECM2O94769 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ECM2O94769 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ECM2O94769 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ECM2O94769 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ECM2O94769 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ECM2O94769 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ECM2O94769 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ECM2O94769 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ECM2O94769 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms