Protein–RNA interactions for Protein: O75436

VPS26A, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS26AO75436 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS26AO75436 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS26AO75436 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS26AO75436 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS26AO75436 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS26AO75436 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS26AO75436 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS26AO75436 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS26AO75436 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS26AO75436 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS26AO75436 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VPS26AO75436 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
VPS26AO75436 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
VPS26AO75436 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49 ms