Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
ACTN4O43707 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
ACTN4O43707 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
ACTN4O43707 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
ACTN4O43707 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACTN4O43707 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACTN4O43707 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
ACTN4O43707 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
ACTN4O43707 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ACTN4O43707 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
ACTN4O43707 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
ACTN4O43707 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ACTN4O43707 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
ACTN4O43707 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACTN4O43707 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACTN4O43707 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACTN4O43707 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACTN4O43707 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
ACTN4O43707 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACTN4O43707 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACTN4O43707 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACTN4O43707 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACTN4O43707 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACTN4O43707 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
ACTN4O43707 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACTN4O43707 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACTN4O43707 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACTN4O43707 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACTN4O43707 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACTN4O43707 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACTN4O43707 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
ACTN4O43707 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
ACTN4O43707 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACTN4O43707 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACTN4O43707 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACTN4O43707 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACTN4O43707 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACTN4O43707 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACTN4O43707 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
ACTN4O43707 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACTN4O43707 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
ACTN4O43707 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
ACTN4O43707 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms