Protein–RNA interactions for Protein: O43395

PRPF3, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 683 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF3O43395 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRPF3O43395 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PRPF3O43395 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRPF3O43395 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRPF3O43395 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRPF3O43395 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRPF3O43395 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PRPF3O43395 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRPF3O43395 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
PRPF3O43395 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRPF3O43395 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
PRPF3O43395 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRPF3O43395 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
PRPF3O43395 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF3O43395 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF3O43395 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PRPF3O43395 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRPF3O43395 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRPF3O43395 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRPF3O43395 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PRPF3O43395 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPF3O43395 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPF3O43395 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPF3O43395 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPF3O43395 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPF3O43395 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPF3O43395 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PRPF3O43395 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF3O43395 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF3O43395 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF3O43395 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF3O43395 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF3O43395 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF3O43395 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF3O43395 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PRPF3O43395 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF3O43395 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF3O43395 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF3O43395 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF3O43395 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF3O43395 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF3O43395 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PRPF3O43395 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRPF3O43395 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PRPF3O43395 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRPF3O43395 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PRPF3O43395 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPF3O43395 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPF3O43395 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPF3O43395 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPF3O43395 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
PRPF3O43395 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRPF3O43395 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRPF3O43395 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRPF3O43395 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PRPF3O43395 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF3O43395 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF3O43395 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF3O43395 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF3O43395 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF3O43395 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF3O43395 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF3O43395 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF3O43395 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF3O43395 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF3O43395 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
PRPF3O43395 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF3O43395 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF3O43395 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF3O43395 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF3O43395 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF3O43395 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF3O43395 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
PRPF3O43395 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRPF3O43395 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRPF3O43395 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRPF3O43395 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRPF3O43395 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
PRPF3O43395 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF3O43395 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF3O43395 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF3O43395 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PRPF3O43395 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
PRPF3O43395 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF3O43395 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF3O43395 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF3O43395 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF3O43395 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PRPF3O43395 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF3O43395 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF3O43395 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF3O43395 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PRPF3O43395 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF3O43395 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF3O43395 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF3O43395 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF3O43395 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
PRPF3O43395 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF3O43395 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
PRPF3O43395 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11 ms