Protein–RNA interactions for Protein: O00291

HIP1, Huntingtin-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIP1O00291 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HIP1O00291 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HIP1O00291 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HIP1O00291 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HIP1O00291 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HIP1O00291 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HIP1O00291 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HIP1O00291 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HIP1O00291 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HIP1O00291 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HIP1O00291 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HIP1O00291 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HIP1O00291 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HIP1O00291 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
HIP1O00291 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HIP1O00291 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
HIP1O00291 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HIP1O00291 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HIP1O00291 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HIP1O00291 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HIP1O00291 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HIP1O00291 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
HIP1O00291 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIP1O00291 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIP1O00291 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIP1O00291 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIP1O00291 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIP1O00291 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
HIP1O00291 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIP1O00291 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIP1O00291 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HIP1O00291 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIP1O00291 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIP1O00291 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIP1O00291 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIP1O00291 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIP1O00291 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIP1O00291 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIP1O00291 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIP1O00291 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIP1O00291 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIP1O00291 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HIP1O00291 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HIP1O00291 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HIP1O00291 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
HIP1O00291 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HIP1O00291 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HIP1O00291 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HIP1O00291 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HIP1O00291 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
HIP1O00291 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
HIP1O00291 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HIP1O00291 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HIP1O00291 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HIP1O00291 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
HIP1O00291 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HIP1O00291 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
HIP1O00291 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HIP1O00291 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
HIP1O00291 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HIP1O00291 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HIP1O00291 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
HIP1O00291 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
HIP1O00291 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HIP1O00291 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
HIP1O00291 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
HIP1O00291 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HIP1O00291 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
HIP1O00291 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HIP1O00291 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HIP1O00291 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
HIP1O00291 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIP1O00291 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIP1O00291 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIP1O00291 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIP1O00291 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIP1O00291 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIP1O00291 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
HIP1O00291 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HIP1O00291 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HIP1O00291 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HIP1O00291 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
HIP1O00291 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HIP1O00291 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HIP1O00291 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
HIP1O00291 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HIP1O00291 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HIP1O00291 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HIP1O00291 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
HIP1O00291 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
HIP1O00291 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HIP1O00291 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
HIP1O00291 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HIP1O00291 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HIP1O00291 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HIP1O00291 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HIP1O00291 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
HIP1O00291 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
HIP1O00291 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
HIP1O00291 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms