Protein–RNA interactions for Protein: O00203

AP3B1, AP-3 complex subunit beta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B1O00203 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
AP3B1O00203 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
AP3B1O00203 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
AP3B1O00203 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms