Protein–RNA interactions for Protein: H3BNC9

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3BNC9 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
H3BNC9 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H3BNC9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
H3BNC9 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
H3BNC9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
H3BNC9 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H3BNC9 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H3BNC9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
H3BNC9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H3BNC9 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
H3BNC9 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
H3BNC9 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
H3BNC9 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
H3BNC9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
H3BNC9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
H3BNC9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
H3BNC9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
H3BNC9 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
H3BNC9 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
H3BNC9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
H3BNC9 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
H3BNC9 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
H3BNC9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
H3BNC9 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
H3BNC9 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
H3BNC9 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H3BNC9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H3BNC9 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
H3BNC9 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H3BNC9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H3BNC9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
H3BNC9 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H3BNC9 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H3BNC9 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
H3BNC9 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
H3BNC9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
H3BNC9 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
H3BNC9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
H3BNC9 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H3BNC9 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H3BNC9 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
H3BNC9 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
H3BNC9 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
H3BNC9 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
H3BNC9 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
H3BNC9 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
H3BNC9 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
H3BNC9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
H3BNC9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H3BNC9 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
H3BNC9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
H3BNC9 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
H3BNC9 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
H3BNC9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
H3BNC9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
H3BNC9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
H3BNC9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
H3BNC9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
H3BNC9 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
H3BNC9 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
H3BNC9 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
H3BNC9 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
H3BNC9 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
H3BNC9 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
H3BNC9 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
H3BNC9 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
H3BNC9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
H3BNC9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
H3BNC9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
H3BNC9 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
H3BNC9 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
H3BNC9 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
H3BNC9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
H3BNC9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
H3BNC9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
H3BNC9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H3BNC9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H3BNC9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H3BNC9 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
H3BNC9 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
H3BNC9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
H3BNC9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H3BNC9 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H3BNC9 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H3BNC9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H3BNC9 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H3BNC9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
H3BNC9 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
H3BNC9 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H3BNC9 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
H3BNC9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H3BNC9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
H3BNC9 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
H3BNC9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
H3BNC9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
H3BNC9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H3BNC9 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H3BNC9 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
H3BNC9 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
H3BNC9 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.2 ms